無論任何時候，傳統醫學不能解決某個醫學問題，在開始臭氧治療之前，醫生都有責任給病人所有可能的治療選項。臭氧治療可以治療各種慢性缺血性疾病、缺血或糖尿病造成的皮膚慢性潰瘍，萎縮性老年黃斑變性以及各種免疫相關疾病。在慢性肢體缺血，傳統治療用類前列腺素滴注進行治療， 低于臭氧治療，治療費用比臭氧昂貴。臭氧治療可以 70%的黃斑變性（干性），因為傳統醫學沒有良好的治療選項。以下列舉臭氧聯合傳統治療的疾病：

1、慢性缺血性疾病（腦、心臟）。臭氧可以發回有益的治療影響。因為A、提高缺血組織內氧、葡萄糖、ATP的運送；B、增強血管新生、促進造血 的植入，進而提高新血管形成和組織再生；C、通過上調抗氧化酶和血紅素加氧酶I的表達誘導預處理現象；D、觸發神經元介質反應，改善生活質量。實驗顯示對于晚期心臟病患者，移植和外科血管成形術已經不適合的，聯合臭氧治療和常規治療可以改善病人的預后。

2、骨科疾病（背痛問題）。臭氧椎間盤注射可以達到約75％的成功率，是少數幾項可以通過微創方法解決突出椎間盤的 方法之一。對于治療骨關節病和關節肌腱炎也有三分之二的 率，治療機理與抗傷害系統的活化有關。

3、急、慢性感染性疾病，對于抗生素或耐藥的細菌、病毒、真菌，甚至寄生蟲感染，如：梨形鞭毛蟲病、隱孢子蟲病，在古巴醫生采用臭氧油進行治療。

4、緊急情況，如在大面積創傷、燒傷、急性腹膜炎、毒血癥之后造成的多器官功能衰竭和死亡。聯合傳統治療和一天3-4次的臭氧大自體血療法可以避免或降低代謝損傷的惡化，降低死亡率。另外，等待器官的病人在手術前6-15天之間進行6-8次的臭氧大/小自體血療法，可以提高對于感染的抵抗力和改善免疫抑制（因為麻醉或外科手術）。同時可以減低術后的缺血再灌流損傷。其他的一般手術也可以將臭氧治療作為手術前的準備性治療。

5、骨髓炎、膿胸、腹膜炎、膿瘡、褥瘡、慢性潰瘍、糖尿病足、燒傷、感染性傷口、念珠菌病、甲癬，以上疾病經常伴有抗生素耐藥細菌。如耐二甲氧基苯青霉素的金黃色葡萄球菌，抗生素對于感染區域缺乏效果，與許多發生在發達的死亡病例都有聯系。在這樣的病例，臭氧化的自體血回輸療法和局部使用臭氧化橄欖油或葵花籽油起到快速的抗菌作用，并且令人難以置信的加快傷口愈合。不幸的是，臭氧油應用幾乎不被知道。非常有趣的是，臭氧作為一種非常不穩定的氣體可以被含有不飽和脂肪酸的植物油化合為一種穩定的臭氧化物。當臭氧化油被涂在傷口創面的滲出液上，臭氧化油與生物分子反應，生成并釋放穩定的過氧化氫。消毒作用和改善的氧化作用可以加速疤痕的形成。臭氧化油一旦被人們知道、使用，必將對數以百萬的患者起到極大的治療作用。

6、皰疹病毒感染（HHVI和II）、帶狀皰疹、乳頭瘤病毒感染。使用肌肉內注射的小自體血臭氧療法，作為一種字體疫苗，同時結合臭氧油的局部應用對于預防皰疹的復發非常有作用。這種方法，特別是當聯合使用阿昔洛維時，可以 絕大部分的皰疹感染病人。同時對于減低帶狀皰疹感染和感染之后的神經痛也有非常好的效果。

7、慢性肝炎和艾滋病感染必須分別進行干擾素或活性抗逆轉錄酶治療，因為上述藥物常常可以降低病毒載量。但是，臭氧可以同時作為一種有用的輔助治療。

8、自身免疫性疾病（多發性硬化、類風濕性關節炎、克隆病）。自體血療法是非常令人鼓舞的。

9、退行性疾病。自體血療法可以改善老年性癡呆早期的患者。在另一方面，對于糖尿病性視網膜病、色素性視網膜炎、突聾、慢性耳鳴作用非常小。

10、肺部疾病（肺氣腫、哮喘、COPD、急性呼吸窘迫綜合征）。對于COPD的治療原理如下：A、血液回輸，脂質氧化物可以作用內皮細胞表面，提高前列腺環素和NO的釋放，而內皮縮血管肽I的釋放被抑制。NO和亞硝基硫醇的釋放促進血管舒張，而陰離子超氧化物的釋放會造成血管緊縮，并且對血小板和內皮細胞產生負面影響；B、缺血組織氧輸送的增強、抗氧化酶的加強、血紅素加氧酶I中和慢性氧化應激。C、對于免疫系統刺激可以控制慢性肺部感染。通過臭氧治療COPD可以打到良好的效果，包括改善呼吸系數和步行試驗。

11、晚期腎病被慢性氧化應激加重，不能被傳統藥物控制，臭氧治療穩定嚴重的功能障礙，提高病人的生活治療。

12、臭氧自體血回輸療法聯合臭氧油的局部應用被證明對于代謝綜合征非常 ，比如2型糖尿病患者的難治性慢性潰瘍。同時，控制血糖水平是必須的。

13、皮膚病（牛皮癬、異位性皮炎）。

14、化療藥耐藥的轉移癌、癌性疲勞。通過臭氧治療可以提高病人的生活質量，但是不可以阻斷癌癥的發展。另一方面，外科手術之后臭氧治療非常 ，不僅可以通過誘導抗氧化反應強化細胞對藥物的作用，而且可以降低化療藥的毒性。

15、慢性疲勞綜合征和纖維肌痛。自體血療法已經被發現對于大多數的病人 。

16、口腔科。臭氧對于治療牙根腐爛損傷非常 。臭氧油對于治療口瘡性潰瘍愈合及止痛效果非常好。