臭氧治療儀的使用方法有很多，可以通過直接臭氧注射治療或者將血液中注入臭氧的方式進行治療。對于不同的疾病可以單獨使用某一種臭氧療法或者使用兩種或兩種以上的臭氧療法。臭氧治療可以分為局部治療或者全身治療。

全身治療即采用臭氧大自血療法，局部治療采用臭氧注氣，臭氧套袋療法，臭氧微創介入療法，臭氧油療等等。一般來說全身療法主要是清除血液里的毒素，細菌，多余的脂肪，軟化血管，改善機體內環境。局部療法可以是針對糖尿病足，肩頸，關節等部位治療。目前臭氧大自血療法適用范圍更廣。

適應癥有：

1.心血管疾病：如動脈栓塞、動脈粥樣硬化、心律不齊、冠心病、高血壓

2.呼吸系統疾病：如肺氣腫、哮喘、支氣管炎、慢性肺病

3.感染性疾病：艾滋病、腦炎、腮腺炎、痛風

4.代謝免疫性疾病：如糖尿病、關節炎、腳氣、風濕熱、類風濕性關節炎、接觸性皮炎、系統性紅斑狼瘡

5.腫瘤：如惡性腫瘤、白血病、骨肉瘤等各種類型的腫瘤、術后恢復控制復發

6.外傷：如燒傷、燙傷、糖尿病潰瘍、放射性皮炎或潰瘍等各種原因引起的創傷

7.皮膚病：如濕疹、皮炎、皮膚真菌感染、牛皮癬、帶狀皰疹

8.其它：如慢性疼痛、老年癡呆、偏頭痛